Andrew Peary und Robert Bain gründeten die Miltonduff Distillery im Jahr 1824. Zuvor war die Brennerei seit der Jahrhundertwende illegal auf dem Gelände betrieben worden, doch nach der Verabschiedung des Exercise Act richteten Peary und Bain die Brennerei als legalen Geschäftsbetrieb ein. Nach einem erfolgreichen Start im Jahr 1866 wurde die Brennerei von William Stuart gekauft. Im Jahr 1895 wurde Thomas Yool & Company Miteigentümer der Anlage, und einige Jahre später übernahm Yool die vollständige Kontrolle über die Brennerei.